تم إنشاء قسم المصادر المائية بالمعهد العالي للطاقة (معهد تدريب الكهرباء والماء سابقاً) في العام التدريبي 1992/1993 (ديسمبر عام 1992 م) وذلك لتلبية احتياجات وزارة الكهرباء والماء في مجال العلوم الميكانيكية والكيميائية بما يتعلق بإنتاج وتوزيع المياه العذبة وقليلة الملوحة، وقام القسم باستحداث تخصصات جديدة أثناء مسيرته تماشياً مع تلبية متطلبات جهات عمل أخرى إضافةً الي وزارة الطاقة.
يقوم القسم بتأهيل المتدربين للالتحاق بالعمل في العديد من المجالات التي تخدم جهات مختلفة من سوق العمل في القطاعات الحكومية و الأهلية في مجالات انتاج وتوزيع المياه وخاصة لوزارة الكهرباء و الماء) في مجال محطات التحلية و التقطير و توزيع المياه، كما ان بعض البرامج المستحدثة تمكن خريجي القسم من الالتحاق بالعمل في وزارات الاشغال و الأوقاف و الصحة و شركات البترول في المجالات ذات الطابع الميكانيكي التالية: تشغيل الشبكات المائية، صيانة الشبكات المائية، تشغيل المقطرات و التناضح العكسي، صيانة المقطرات، التشغيل الميكانيكي لمحطات ضخ مياه التبريد، تشغيل و مراقبة أنظمة كفاءة وجودة المياه.